SSCP分析,SNP分型,STR分型 LOH研究,SNP分型,STR分型 CGH,RFLP分析,SNP分型,STR分型

外文名

multiple annealing and looping-based amplification cycles

实质

全基因组扩增技术

又称

MALBAC技术

MALBAC技术

MALBAC

(multiple annealing and looping-based amplification cycles),即多次退火环状循环扩增技术,是"目前最先进的全基因组扩增技术"。该技术于2012年12月刊登于《科学》杂志上(Science).

不同于以往的非线性或指数型扩增方法,

MALBAC

技术利用特殊引物,使得扩增子的结尾互补而成环,从而很大程度上防止了DNA的指数性扩增。

技术特点

1. 起始模板量由微克级(μg)降低到皮克级(pg)。

2. 扩增均匀性远远好于其他扩增技术。

细胞拷贝数CNV分析。

结果分析:分析与标准样品高度一致。

MALBAC技术

3. 90%以上位点可被成功扩增。

技术优势

可适用样品类型
  1. 样本少,常规分析无法进行基因组或转录组分析。

2.  样本高度异质,细胞间存在重大差异。

MALBAC技术和其它WGA技术相比较

WGA技术

主要原理

优点

缺点

应用

MALBAC多次退火环状循环扩增技术操作简单,产量高,最低起始模板几个皮克,结果可靠可重复起始模板量极低时扩增难度加大二代测序、CGH、SNP分型、STR分型、基因克隆、荧光定量
DOP-PCR部分随机引物法操作简单,最低起始模板量达50pg,产物片段大小0.5-10kb起始模板量低时扩增偏差大CGH, SSCP分析,SNP分型,STR分型
LM-PCR连接介导的PCR反应产量高,片段长,对模板DNA质和量要求低操作繁琐,多步操作易丢失模板DNACGH,LOH研究,STR分型
PEP-PCR完全随机引物法对模板DNA质和量要求低,操作简单,易改进,50 ng起始模板可产生0.2-0.5μg产物,最低起始模板量可达5 pg。产量低,保真性差LOH研究,SNP分型,STR分型
MDA多重置换扩增产量高,50 ng起始模板量可产生10-20μg产物,最低起始模板量可达10 pg,忠实性好。起始模板量低时扩增偏差大CGH,RFLP分析,SNP分型,STR分型
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