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单链构象多态性（单链构象多态性）

次浏览 | 更新时间：2023-05-22

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单链构象多态性

单链构象多态性（single-strand conformation polymorphism，SSCP）是一种分离核酸的技术，可以分离相同长度但序列不同的核酸（性质类似于DGGE和TGGE，但方法不同）。

基本信息

中文名	单链构象多态性
外文名	SSCP
定义	分离核酸的技术
领域	生物学

原理

单链构象多态性

单链构象多态性（Single-strand conformation polymorphism，SSCP)分析可以检测DNA序列之间的不同。SSCP首先由Lee 等用于研究自然微生物群体的多样性。在低温条件下，单链DNA呈现一种由内部分子相互作用形成的三维构象，它影响了DNA在非变性凝胶中的迁移率。相同长度但不同核苷酸序列的DNA由于在凝胶中的不同迁移率而被分离。迁移率不同的条带可被银染或者荧光标记引物检测，然后用DNA自动测序进行分析。用PCR-SSCP技术可以进行序列差异的测定，而敏感度会随着片段长度的增加而降低。但是只要条带被凝胶电泳分离开就可以进行系统发育的研究。在Schmalenberger和Tebbe的研究中，测序技术表明一个单链也许包括多种序列，电泳条件也会因此影响基因结构的确定进而影响生物多样性的研究。

实验步骤

利用PCR从提取出的DNA中扩增16S rRNA基因。

利用λ-外切核酸酶消化掉一条链（其中一个PCR引物被磷酸化，这条链将被去除）。

非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。

应用

单链构象多态性可用于预筛选克隆文库。

可对其中的某一个条带进行测序，并与数据库中已知序列比对。

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