《药师如来本愿经》是一部佛教经典，由隋达摩笈多翻译，主要叙述药师如来行菩萨行时所发十二大愿，庄严东方净琉璃世界的事迹。

正文

《药师如来本愿经》，亦称《药师如来本愿功德经》，简称《药师本愿经》、《药师经》。

佛教经典。隋达摩笈多译。一卷。

主要叙述药师如来行菩萨行时所发十二大愿，庄严东方净琉璃世界的事迹。谓彼药师国土一向清净，有日光、月光两菩萨为无量菩萨之上首，劝导众生应生于彼国。又谓凡闻其名号者，均得脱三恶道。

异译本有：东晋帛尸梨蜜多罗译《大灌顶经》第十二卷《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》、唐玄奘译《药师琉璃光如来本愿功德经》一卷、义净译《药师琉璃光七佛本愿功德经》二卷、敦煌遗书斯2512号《药师经疏》所引失译《药师经》。

本经为历代大藏经所收，敦煌遗书亦有收藏。