三卷（或作六卷）。隋·吉藏撰。收在《大正藏》第四十二册。系吉藏于大业四年（608）的讲疏，乃为解释龙树《十二门论》而作。

正文

【十二门论疏】

文中初设标大宗、释题目、叙造论之意、赞论之功能、赞论之利益、作者谦让等六科，释僧睿〈十二门论疏序〉。次立释名、次第、根本、有无、同异等五门。‘释名门’解释本论之题号及观因缘门之名。‘次第门’叙十二门之生起次第。‘根本门’阐明大乘之乘，本诸法实相及一乘佛性之义。‘有无门’述龙树《无畏论》、《中论》，及本论制作的先后、本论偈颂与《中论》偈颂的同异。‘同异门’辨《中论》与本论文义之同异及长行的作者。继而随该论本文加以疏释。文中，并对犊子部、有部、摄论师、成实师、宝亮、智藏等所说，加以论评。

本书与同为吉藏所著《中观论疏》十卷、《百论疏》三卷，皆为三论宗所依论疏。且与法藏《十二门论宗致义记》，并称为十二门论注疏的双璧。其注疏有《闻思记》一卷、《翼赞钞序》一卷等。