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目前参与中心运作的部门有贸易及工业部、运输部、国防部、环境食品部、教育部、外交及英联邦办公室，另外自然环境研究局、英国气象局、原子物理及天文研究局、拉塞福实验室亦有派人参与中心工作。

有别于各国的太空总署，英国国家太空中心只扮演统筹角色，而无权制定太空政策。在英国每年约拨出4亿美元太空经费中，大部分都流向欧洲空间局。中心每年的预算只有200万美元。

英国科学家对中心缺乏独立能力一直提出反对。而中国及印度太空的技术提升也多次成为英国本土要求增拨太空预算的理据。2007年英国皇家学会就曾公开呼吁政府成立一个近似美国国家航空航天局的组织，取代目前中心的职能。英国太空工业组织UKspace亦指英国太空政策落在不同部门手中，没有中央机构能推动本土工业发展。连串举动令英国成立独立太空总署的呼声越高。